SUMMARY OF PM7 CALCULATION, Site No: 23746
MOPAC2016 (Version: 21.055M)
Thu Feb 25 03:16:53 2021
No. of days remaining = 364
Empirical Formula: C80 H96 N32 O32 = 240 atoms
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Thymine (THYMIN01)
h=-110.6 hr=nist
GEOMETRY OPTIMISED USING EIGENVECTOR FOLLOWING (EF).
SCF FIELD WAS ACHIEVED
HEAT OF FORMATION = -1881.51348 KCAL/MOL = -7872.25239 KJ/MOL
H.o.F. per unit cell = -117.59459 KCAL, for 16 unit cells, unit cell = C5 H6 N2 O2
TOTAL ENERGY = -26554.09053 EV
ELECTRONIC ENERGY = -104950241.11961 EV
CORE-CORE REPULSION = 104923687.02908 EV
VOLUME OF UNIT CELL = 533.508 CUBIC ANGSTROMS
DENSITY = 1.570 GRAMS/CC
A = 6.853 ANGSTROMS
B = 6.840 ANGSTROMS
C = 11.847 ANGSTROMS
ALPHA = 73.875 DEGREES
BETA = 90.085 DEGREES
GAMMA = 90.146 DEGREES
VOLUME OF CLUSTER = 2134.03127 ANGSTROMS**3 = 1285.143 CM**3/MOLE
GRADIENT NORM = 32.92392 = 2.12523 PER ATOM
NO. OF FILLED LEVELS = 384
IONIZATION POTENTIAL = 9.752613 EV
HOMO LUMO ENERGIES (EV) = -9.753 -0.710
MOLECULAR WEIGHT = 2017.8336
Pressure required to constrain translation vectors
Tv( 241) Pressure: 0.73 GPa
Tv( 242) Pressure: 0.79 GPa
Tv( 243) Pressure: 0.64 GPa
SCF CALCULATIONS = 24
WALL-CLOCK TIME = 13 MINUTES AND 5.941 SECONDS
COMPUTATION TIME = 12 MINUTES AND 47.423 SECONDS
FINAL GEOMETRY OBTAINED
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Thymine (THYMIN01)
h=-110.6 hr=nist
O -0.11960703 +1 -0.00921641 +1 0.20264542 +1
O 3.14649501 +1 -2.39127670 +1 2.22877899 +1
N 1.61094176 +1 1.16278814 +1 1.10961307 +1
N 1.47171713 +1 -1.21106540 +1 1.31343733 +1
C 0.93772325 +1 -0.02442350 +1 0.83568310 +1
C 2.72971911 +1 -1.28067521 +1 1.96816947 +1
C 3.35660052 +1 0.00054031 +1 2.26527468 +1
C 2.81069484 +1 1.15753389 +1 1.80630315 +1
C 4.58352876 +1 -0.03204174 +1 3.09138070 +1
H 1.27922214 +1 2.02579526 +1 0.64907066 +1
H 1.01416227 +1 -2.09137298 +1 1.01985430 +1
H 3.26338974 +1 2.15363067 +1 1.97415503 +1
H 4.92494373 +1 0.96598453 +1 3.40780700 +1
H 4.42313911 +1 -0.61136782 +1 4.01685698 +1
H 5.43489063 +1 -0.48578910 +1 2.55577797 +1
O 0.75180091 +1 -3.30654987 +1 -3.05602600 +1
O 4.03845883 +1 -0.90986211 +1 -1.07417573 +1
N 2.49173167 +1 -4.46961833 +1 -2.15698418 +1
N 2.35173281 +1 -2.09496943 +1 -1.96423627 +1
C 1.81263233 +1 -3.28399907 +1 -2.43023966 +1
C 3.61620820 +1 -2.02141606 +1 -1.32093823 +1
C 4.24095470 +1 -3.30081049 +1 -1.01392461 +1
C 3.69515659 +1 -4.46025323 +1 -1.46711558 +1
C 5.46188510 +1 -3.25918808 +1 -0.17862156 +1
H 2.15695393 +1 -5.33528178 +1 -2.61003535 +1
H 1.88909381 +1 -1.21591459 +1 -2.25145253 +1
H 4.14967690 +1 -5.45444133 +1 -1.29844974 +1
H 5.80340524 +1 -4.25475717 +1 0.14530368 +1
H 5.28946769 +1 -2.67446973 +1 0.74304804 +1
H 6.31477475 +1 -2.80229531 +1 -0.70710587 +1
O -0.52251719 +1 0.10053433 +1 3.21475570 +1
O -3.76491631 +1 2.48812874 +1 1.15538342 +1
N -2.23476479 +1 -1.06631524 +1 2.27787623 +1
N -2.09993504 +1 1.31133115 +1 2.09019626 +1
C -1.57025308 +1 0.12309592 +1 2.56529829 +1
C -3.34826360 +1 1.37715947 +1 1.41780981 +1
C -3.97065118 +1 0.09598814 +1 1.11313132 +1
C -3.43034115 +1 -1.06244348 +1 1.57446966 +1
C -5.19442969 +1 0.13482992 +1 0.28513328 +1
H -1.90425304 +1 -1.93002892 +1 2.73999097 +1
H -1.65233366 +1 2.19274464 +1 2.39577108 +1
H -3.88142064 +1 -2.05774392 +1 1.40677881 +1
H -5.53699855 +1 -0.86090409 +1 -0.03601130 +1
H -5.02772406 +1 0.72163693 +1 -0.63675021 +1
H -6.04506602 +1 0.59111570 +1 0.81980444 +1
O 0.39779203 +1 3.40279074 +1 -0.09991919 +1
O -2.86263394 +1 1.01482296 +1 -2.13131427 +1
N -1.35417300 +1 4.56758774 +1 -0.97147733 +1
N -1.19741931 +1 2.19700073 +1 -1.20056952 +1
C -0.66896164 +1 3.38445235 +1 -0.71754543 +1
C -2.45558960 +1 2.12504486 +1 -1.85307356 +1
C -3.08903756 +1 3.40487309 +1 -2.14103742 +1
C -2.54929972 +1 4.56245304 +1 -1.67563780 +1
C -4.31230817 +1 3.36929537 +1 -2.97248009 +1
H -1.01231651 +1 5.44048703 +1 -0.53448493 +1
H -0.72658560 +1 1.31945741 +1 -0.92441397 +1
H -2.99550942 +1 5.55940266 +1 -1.84933521 +1
H -4.65195868 +1 4.36611149 +1 -3.29481477 +1
H -4.14798595 +1 2.78298432 +1 -3.89417061 +1
H -5.16478304 +1 2.91657542 +1 -2.43923113 +1
O -0.09089445 +1 -6.85932761 +1 0.15935537 +1
O 3.15238885 +1 -9.24164261 +1 2.22594157 +1
N 1.61817802 +1 -5.68827827 +1 1.10246303 +1
N 1.48897281 +1 -8.06505175 +1 1.28461455 +1
C 0.95695224 +1 -6.87697063 +1 0.80816272 +1
C 2.73807257 +1 -8.13148427 +1 1.95479679 +1
C 3.36130499 +1 -6.85006090 +1 2.25722639 +1
C 2.81745464 +1 -5.69195957 +1 1.79994825 +1
C 4.58732902 +1 -6.88684440 +1 3.08268153 +1
H 1.27834115 +1 -4.81878575 +1 0.65437914 +1
H 1.04028111 +1 -8.94737819 +1 0.98461701 +1
H 3.26725738 +1 -4.69602916 +1 1.96960711 +1
H 4.92715370 +1 -5.88804936 +1 3.40223823 +1
H 4.42653833 +1 -7.46870755 +1 4.00752171 +1
H 5.43645233 +1 -7.34089171 +1 2.54515845 +1
O 0.79655125 +1 -10.15746868 +1 -3.09417782 +1
O 4.05450693 +1 -7.78012719 +1 -1.05231849 +1
N 2.51779692 +1 -11.33255996 +1 -2.17338215 +1
N 2.38342331 +1 -8.95770610 +1 -1.97662370 +1
C 1.84934677 +1 -10.14437877 +1 -2.45314407 +1
C 3.63749562 +1 -8.89015561 +1 -1.31582512 +1
C 4.26046415 +1 -10.17135969 +1 -1.01336361 +1
C 3.71420544 +1 -11.32774699 +1 -1.47247808 +1
C 5.48374195 +1 -10.13313035 +1 -0.18335778 +1
H 2.18216564 +1 -12.20147888 +1 -2.62319607 +1
H 1.92292945 +1 -8.07804440 +1 -2.26579772 +1
H 4.16110391 +1 -12.32551187 +1 -1.30170867 +1
H 5.82874835 +1 -11.12860300 +1 0.13617752 +1
H 5.31687660 +1 -9.55220395 +1 0.74189199 +1
H 6.33343774 +1 -9.67331812 +1 -0.71499794 +1
O -0.50930254 +1 -6.75465740 +1 3.20238505 +1
O -3.75746006 +1 -4.37778524 +1 1.14551000 +1
N -2.21456438 +1 -7.93273766 +1 2.25444964 +1
N -2.08926511 +1 -5.55448339 +1 2.07505403 +1
C -1.55355777 +1 -6.74270090 +1 2.54854456 +1
C -3.34319063 +1 -5.48718230 +1 1.41299889 +1
C -3.96750756 +1 -6.76880778 +1 1.11132549 +1
C -3.41807762 +1 -7.92626945 +1 1.56305293 +1
C -5.19043462 +1 -6.73382751 +1 0.28038365 +1
H -1.90619330 +1 -8.79067398 +1 2.74426715 +1
H -1.64131620 +1 -4.67405101 +1 2.37842581 +1
H -3.87150767 +1 -8.92147987 +1 1.39723828 +1
H -5.53144920 +1 -7.73238292 +1 -0.03854482 +1
H -5.01779262 +1 -6.15163129 +1 -0.64359458 +1
H -6.04566905 +1 -6.27724975 +1 0.80554267 +1
O 0.38726990 +1 -3.43985240 +1 -0.05819741 +1
O -2.85255105 +1 -5.82856490 +1 -2.11912529 +1
N -1.33283703 +1 -2.27099143 +1 -0.98490278 +1
N -1.19092821 +1 -4.64489433 +1 -1.18527429 +1
C -0.66266716 +1 -3.45853346 +1 -0.70336861 +1
C -2.44466491 +1 -4.71721870 +1 -1.84593557 +1
C -3.07782666 +1 -3.43845970 +1 -2.13765072 +1
C -2.53529768 +1 -2.28017208 +1 -1.67787154 +1
C -4.30331943 +1 -3.47942779 +1 -2.96441325 +1
H -0.99444444 +1 -1.40168637 +1 -0.53789058 +1
H -0.72209026 +1 -5.52530638 +1 -0.91112164 +1
H -2.98960866 +1 -1.28580043 +1 -1.84349903 +1
H -4.64325064 +1 -2.48407992 +1 -3.28951818 +1
H -4.13994133 +1 -4.06843131 +1 -3.88363850 +1
H -5.15369732 +1 -3.93331959 +1 -2.42924885 +1
O 1.63788001 +1 -0.01252580 +1 -6.34246248 +1
O 4.92275351 +1 -2.38391963 +1 -4.33240601 +1
N 3.36317823 +1 1.16510469 +1 -5.43269443 +1
N 3.23740003 +1 -1.21113961 +1 -5.23705762 +1
C 2.69481698 +1 -0.02524926 +1 -5.71052996 +1
C 4.49747778 +1 -1.27462061 +1 -4.58642510 +1
C 5.11722480 +1 0.00881495 +1 -4.28354882 +1
C 4.56562402 +1 1.16361038 +1 -4.73944881 +1
C 6.33980394 +1 -0.02238584 +1 -3.45114587 +1
H 3.02785739 +1 2.02928523 +1 -5.89067167 +1
H 2.78290019 +1 -2.09005899 +1 -5.53085589 +1
H 5.01334255 +1 2.16092335 +1 -4.57026164 +1
H 6.68135067 +1 0.97645167 +1 -3.13349106 +1
H 6.16827783 +1 -0.60308701 +1 -2.52672159 +1
H 7.19337812 +1 -0.47883326 +1 -3.97752074 +1
O 2.53406073 +1 -3.29270282 +1 -9.68918583 +1
O 5.78242259 +1 -0.90431288 +1 -7.63806012 +1
N 4.25120512 +1 -4.46079911 +1 -8.75721704 +1
N 4.11279919 +1 -2.08490186 +1 -8.56393272 +1
C 3.58280360 +1 -3.27338439 +1 -9.04414446 +1
C 5.36619676 +1 -2.01447497 +1 -7.90065026 +1
C 5.98891685 +1 -3.29603769 +1 -7.59207072 +1
C 5.44546952 +1 -4.45441338 +1 -8.05051187 +1
C 7.20816839 +1 -3.25784899 +1 -6.75423249 +1
H 3.92426809 +1 -5.32520738 +1 -9.21936877 +1
H 3.66294424 +1 -1.20621366 +1 -8.86881349 +1
H 5.89176891 +1 -5.44942663 +1 -7.87359043 +1
H 7.54868222 +1 -4.25455686 +1 -6.43275601 +1
H 7.03730658 +1 -2.67411372 +1 -5.83155124 +1
H 8.06235514 +1 -2.80253065 +1 -7.28332455 +1
O 1.23888109 +1 0.11592702 +1 -3.32478986 +1
O -2.00022917 +1 2.49151468 +1 -5.40145957 +1
N -0.47086865 +1 -1.05807149 +1 -4.26122089 +1
N -0.33669982 +1 1.31756482 +1 -4.45930243 +1
C 0.19318083 +1 0.13133334 +1 -3.97574894 +1
C -1.58799417 +1 1.38121210 +1 -5.12817831 +1
C -2.21136700 +1 0.09966589 +1 -5.42793916 +1
C -1.66786027 +1 -1.05599135 +1 -4.96293825 +1
C -3.43493005 +1 0.13308937 +1 -6.25819904 +1
H -0.13486882 +1 -1.92141908 +1 -3.80202230 +1
H 0.11478223 +1 2.20001018 +1 -4.16481040 +1
H -2.11756549 +1 -2.05203809 +1 -5.12898079 +1
H -3.77592021 +1 -0.86510273 +1 -6.57546901 +1
H -3.27039891 +1 0.71328238 +1 -7.18337769 +1
H -4.28540569 +1 0.58956339 +1 -5.72329379 +1
O 2.13989931 +1 3.40360587 +1 -6.66539715 +1
O -1.12243260 +1 1.01827839 +1 -8.69016989 +1
N 0.41281214 +1 4.57529567 +1 -7.57577625 +1
N 0.55618382 +1 2.19897125 +1 -7.78338390 +1
C 1.08562231 +1 3.38761580 +1 -7.30193550 +1
C -0.70436421 +1 2.12935207 +1 -8.43338798 +1
C -1.33292521 +1 3.41062439 +1 -8.73050277 +1
C -0.78849664 +1 4.56721267 +1 -8.27093965 +1
C -2.55832397 +1 3.37866449 +1 -9.55877625 +1
H 0.72099766 +1 5.43242263 +1 -7.08563666 +1
H 1.00843781 +1 1.32282789 +1 -7.47444471 +1
H -1.24692861 +1 5.56188514 +1 -8.43076723 +1
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